Résumé 120 :
Analyse multi-patients de données génomiques
Grimonprez, Quentin ; Celisse, Alain ; Marot, Guillemette
DGA-Inria
Les technologies à haut-débit en génomique génèrent des observations pour des millions de variables sur des centaines d'individus. Outre le problème de la sélection de marqueurs en très grande dimension qui reste encore très ouvert, des techniques de normalisation et de segmentation des profils génomiques ont été développées ces dernières années. Nous aborderons l'analyse multi-patients de données génomiques de deux manières différentes: (i) en fournissant une suite d'outils adaptés à une analyse individuelle complète et en proposant de nouveaux choix de paramètres pour automatiser ces analyses individuelles parfois difficiles (ii) en analysant simultanément tous les profils génomiques pour sélectionner des marqueurs qui permettent de prédire la réponse des patients pour une variable donnée (binaire ou quantitative). Nous illustrerons ces deux approches à partir du package MPAgenomics, que nous développons sur la forge R.