Résumé 73 :
Analyse statistique des propriétés physicochimiques des acides aminés des régions hypervariables des anticorps
Aouinti, Safa ; Malouche, Dhafer ; Lefranc, Marie-Paule
IMGT- IGH (CNRS)/ Ecole Nationale d'ingénieurs de Tunis- Tunisie
Un anticorps est une protéine de la réponse immunitaire d'un organisme qui détecte et neutralise spécifiquement les antigènes de toute substance étrangère à l'organisme afin de les éliminer. Un anticorps est constitué de deux chaînes lourdes (H) et de deux légères (L) kappa ou lambda. Chaque chaîne comprend un domaine variable V et une région constante C. Le domaine V est constitué de trois régions hypervariables ou CDR (complementarity determining region) qui déterminent le site de reconnaissance et de liaison à l'antigène et de quatre régions charpentes ou FR (framework region). Des analyses multivariées (analyses des correspondances couplées à des classifications ascendantes hiérarchiques) ont été menées sur les propriétés physicochimiques des acides aminés des CDR des séquences d' IMGT/LIGM-DB (http://www.imgt.org), localisés selon la numérotation unique IMGT. Pour les CDR1-IMGT et CDR2-IMGT codés par les gènes V, l’analyse a été effectuée sur 36811 séquences (23174 IGHV, 7460 IGKV et 6177 IGLV) et pour les CDR3-IMGT, lesquels résultent des réarrangements des gènes V-(D)-J, sur 7961 séquences (2178 VH, 3084 V-KAPPA et 2699 V-LAMBDA). Cette étude a permis de localiser les positions importantes pour la diversité et, en contraste, pour le maintien de la structure du domaine V de l'anticorps.